La XI Media Maratón Villa de San Javier 2016 saldrá de la Pista de Atletismo y trascurrirá por las siguientes calles: Maestre, Monasterio de Sigena, Alcántara, Avenida Aviación, Avenida Mar Menor, Ronda Este, Fuerzas Armadas, Castillo de Javier, Galicia, López Peña, Paseo Colón y Ronda de Poniente. Habrá pasos de cruce en la Rotonda de "Cuatro Picos" y en la Carretera del Aeropuerto.
El horario de corte aproximado será de 9:45 a 11:30 h.